NatureCommunication

时间:2022/5/10 17:38:24 来源:白血病_白血病的预防与诊治 作者:佚名

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急性白血病是最常见的儿童肿瘤,其中急性髓系白血病(AML)约占15-20%,其整体预后较差,5年生存率约为65-70%。当前,儿童AML的危险度分层尚没有统一的参考标准。基于下一代测序(NGS)的基因组分析发现了儿童AML中的基因组变异图谱并检测到与预后相关的关键分子变异。

同时研究表明儿童和成人癌症驱动基因组变异谱存在显著差异。然而,这些研究主要基于西方患儿开展,目前的研究结果在中国儿童中否存在偏倚尚不清楚。

近日,国家儿童医学中心/上海儿童医学中心沈树红和刘宇研究团队在NatureCommunications发表题为DistinctgenomiclandscapeofChinesepediatricacutemyeloidleukemiaimpactsclinicalriskclassification的研究论文,通过对中国儿童AML患者的初发肿瘤样本进行基因组分析,详细描绘了中国儿童急性髓系白血病基因组驱动变异特征,揭示了我国AML患儿不同于西方人群的特有驱动变异及组合,并进一步根据其对预后、临床分层的影响,建立了适合中国儿童AML的危险分层模型。为我国儿童AML精准医疗的开展奠定了基础。

本研究基于上海儿童医学中心-近二十年间建立的儿童AML研究队列,对共计名初发AML(AML-SCMC-方案为主)患者的肿瘤样本进行了RNA-seq分析。通过与全基因组测序及深度靶向捕获测序结果的对比,研究团队证明了该分析方法具有较高的灵敏度和特异性,并以此为基础描绘了中国儿童急性髓系白血病的驱动基因组变异图谱。通过分析,作者首先描绘了中国儿童AML的驱动变异及其共突变关系,并发现了此前未曾在AML中报道过的XPO1相关融合基因XPO1-TNRC18和XPO1-MLLT10。有趣的是,所有病例均属于FAB-M7亚型且不携带其他AML相关驱动变异,提示该融合基因可能为新型AML-M7驱动变异,其致病机制需要进一步的实验研究。研究者接下来通过对比代表西方患儿的TARGETAML突变数据,发现不同遗传背景下儿童AML的基因突变频率及基因突变的共现性具有显著的差异,且该差异主要来自于3-14岁的AML患者。值得注意的是,RAS信号通路在中国患儿中的突变频率显著低于西方人群。为了回答这些驱动变异间的差异是否与患者临床预后相关,作者接下来在中国患儿中开展了基于驱动变异的生存分析。此外,研究者还根据该项研究中建立的驱动变异及临床相关性对版EuropeanLeukemiaNet(ELN)危险分层模型进行了修正,建立了基于中国儿童AML临床基因组分析结果的风险度分层模型——SCMC-pAML。与ELN模型相比,SCMC-pAML可以更有效地鉴别高危(HR)和低危(LR)AML患儿。

该项研究详细描绘了中国儿童急性髓系白血病独特的基因组图谱,强调了遗传背景是基于基因组变异的临床精准医学中重要的影响因素,提示建立针对我国白血病患儿的危险度分层体系的必要性。“我们的这项工作仅仅为我国儿童白血病的精准化、个体化治疗开了个头,未来还需要更加深入的探索,对儿童AML的危险度进行更精细的分层,并对新型靶点深入研究以期对可治疗的分层因素开展精准治疗,根本上提高儿童AML的疗效,提高远期预后及患儿生存质量。但这些工作有待于同道同心协力开展多中心的临床研究和转化研究。”文章通讯作者国家儿童医学中心/上海儿童医学中心血液肿瘤科主任沈树红医生介绍说。

作者信息

上海儿童医学中心血液肿瘤科研究生刘婷、转化所饶建安及血液肿瘤科胡文婷为该论文共同第一作者。

论文发表后被编辑选作肿瘤领域近期50篇重点推荐文章(

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